Клиническая Микробиология и Антимикробная Химиотерапия
2014; Том 16 (4): 245-328

Болезни и возбудители

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(4):248-253

Бактериологическая и молекулярно-генетическая верификация бактериемии у ВИЧ-инфицированных больных

Н.С. Соловьёва, Т.Ф. Оттен, В.Ю. Журавлёв, Н.Н. Гащенко, М.В. Шульгина

Проведено сравнение эффективности микробиологических и молекулярно-генетических методов идентификации инфекционного агента в 130 образцах венозной крови при септических состояниях у больных ВИЧ-инфекцией. Инфекционный агент был выявлен в 45,4% образцов. Посев на жидкие среды позволил выделить культуру возбудителя в 37,7% образцов, ПЦР-РВ для выявления ДНК микобактерий туберкулёзного комплекса — ещё в 10 (7,7%) образцах. M. tuberculosis был выявлен в 29,2% этиологически верифицированных случаев, M. avium и M. intracellulare — в 9,2%. Комплекс молекулярно-генетических и современных микробиологических методов позволили повысить эффективность этиологической диагностики септических состояний и сократить время получения результатов исследования.

бактериемия, сепсис, ВИЧ-инфекция, туберкулёз, M. tuberculosis

Антибиотикорезистентность

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(4):254-265

Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacteriaceae в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011–2012 гг.

М.В. Сухорукова, М.В. Эйдельштейн, Е.Ю. Склеенова, Н.В. Иванчик, А.В. Тимохова, А.В. Дехнич, Р.С. Козлов, исследовательская группа «МАРАФОН»

Бактерии семейства Enterobacteriaceae в совокупности являются наиболее частыми возбудителями нозокомиальных инфекций. В данной статье представлены результаты оценки чувствительности к антибактериальным препаратам 573 изолятов Enterobacteriaceae, выделенных в рамках многоцентрового эпидемиологического исследования антибиотикорезистентности возбудителей нозокомиальных инфекций (МАРАФОН) в 25 стационарах 18 городов России в 2011–2012 гг. Энтеробактерии составили в общей сложности 33,7% всех выделенных бактериальных возбудителей. Наиболее частыми видами были Klebsiella pneumoniae (16,9%), Escherichia coli (7,9%) и Enterobacter cloacae (2,6%). Подавляющее большинство исследованных изолятов были нечувствительны к оксиимино-β-лактамам — цефотаксиму (83,8%), цефтазидиму (81,3%), цефепиму (79,1%) и азтреонаму (80,6%). Продукция β-лактамаз расширенного спектра (ESBL) обнаружена у 78,2% всех изолятов, в том числе, у 90,6% K. pneumoniae и 82,1% E. coli. Нечувствительность к карбапенемам — меропенему, имипенему и эртапенему, проявляли соответственно 2,8, 8,4 и 14,0% изолятов, в большинстве случаев — K. pneumoniae. У 3,7% изолятов выявлена продукция карбапенемаз групп OXA-48 (3,3%) и NDM-1 (0,4%). Большинство изолятов были нечувствительны к тобрамицину (74,0%), гентамицину (60,4%), ципрофлоксацину (70,5%) и триметоприму/сульфаметоксазолу (63,7%). Среди не-β-лактамных антибиотиков наиболее высокую активность in vitro проявляли фосфомицин, тигециклин, колистин и амикацин, нечувствительными к которым были соответственно 14,1, 15,9, 16,1 и 36,1% всех изолятов. Фенотипом экстремальной резистентности (XDR) обладали 11,7% изолятов.

Enterobacteriaceae, E. coli, K. pneumoniae, антибиотикорезистентность, нозокомиальные инфекции

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(4):266-272

Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011–2012 гг.

М.В. Сухорукова, М.В. Эйдельштейн, Е.Ю. Склеенова, Н.В. Иванчик, А.В. Тимохова, Е.А. Шек, А.В. Дехнич, Р.С. Козлов, исследовательская группа «МАРАФОН»

Acinetobacter baumannii и родственные виды, относящиеся к Acintobacter calcoaceticus-baumannii complex, являются одними из наиболее проблемных возбудителей нозокомиальных инфекций. В данной статье представлены результаты оценки чувствительности к антибактериальным препаратам 252 изолятов Acinetobacter spp., выделенных в рамках многоцентрового эпидемиологического исследования антибиотикорезистентности возбудителей нозокомиальных инфекций (МАРАФОН) в 25 стационарах 18 городов России в 2011–2012 гг. Acinetobacter spp., в частности A. baumannii, составили соответственно 14,8 и 13,9% всех выделенных бактериальных возбудителей. Нечувствительность к карбапенемам (меропенему и имипенему) проявляли соответственно 67,5 и 96,0% изолятов, что на 28,9 и 90,9% выше аналогичных показателей в 2006–2007 гг. У 46,8% изолятов A. baumannii выявлено наличие генов приобретённых карбапенемаз молекулярного класса D, относящихся к группам OXA-40 (38,0%), OXA-23 (4,6%) и OXA-58 (4,2%); у одного изолята A. pittii — наличие гена металло-β-лактамазы NDM-типа. Большинство изолятов были также нечувствительны к фторхинолонам — ципрофлоксацину и левофлоксацину (92,1%), аминогликозидам — гентамицину (85,3%), амикацину (86,9%) и тобрамицину (64,7%), а также к триметоприму/сульфаметоксазолу (79,4%). Наиболее высокую активность in vitro проявлял колистин (1,6% резистентных изолятов). Значения МПК тигециклина и сульбактама превышали уровни эпидемиологических точек отсечения для штаммов «дикого типа» (ECOFF 1 и 4 мг/л) у 55,6 и 63,1% изолятов соответственно. Фенотипом экстремальной резистентности (XDR) обладали 86,9% изолятов, а фенотипом панрезистентности (PDR) — 1,2% изолятов Acinetobacter spp.

Acinetobacter spp., антибиотикорезистентность, нозокомиальные инфекции

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(4):273-279

Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Pseudomonas aeruginosa в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011–2012 гг.

М.В. Сухорукова, М.В. Эйдельштейн, Е.Ю. Склеенова, Н.В. Иванчик, А.В. Тимохова, Е.А. Шек, А.В. Дехнич, Р.С. Козлов, исследовательская группа «МАРАФОН»

Pseudomonas aeruginosa является самым частым среди всех видов бактерий возбудителем нозокомиальных инфекций в РФ. В данной статье представлены результаты оценки чувствительности к антибактериальным препаратам 343 изолятов P. aeruginosa, выделенных в рамках многоцентрового эпидемиологического исследования антибиотикорезистентности возбудителей нозокомиальных инфекций (МАРАФОН) в 25 стационарах 18 городов России в 2011–2012 гг. Доля изолятов P. aeruginosa среди всех бактериальных возбудителей составила 20,2%. Нечувствительность к антисинегнойным цефалоспоринам — цефепиму и цефтазидиму, проявляли 58,9 и 60,9% изолятов, к пиперациллину/тазобактаму — 67,1%, к карбапенемам — имипенему и меропенему — 88,0 и 66,8% изолятов соответственно. У 28,3% изолятов выявлена продукция металло-β-лактамаз (MBL) VIM-типа. Большинство изолятов были также нечувствительны к фторхинолонам — ципрофлоксацину (67,6%) и левофлоксацину (70,8%), аминогликозидам — гентамицину (62,7%), амикацину (57,7%) и тобрамицину (50,1%). Наиболее высокую активность in vitro проявляли полимиксины — колистин и полимиксин B (3,2 и 4,7% нечувствительных изолятов соответственно). Значения МПК фосфомицина превышали уровень эпидемиологической точки отсечения для штаммов «дикого типа» (ECOFF 128 мг/л) у 11,1% изолятов. Фенотипом экстремальной резистентности (XDR) обладали 57,4% изолятов, а фенотипом панрезистентности (PDR) — 0,3% изолятов.

Pseudomonas aeruginosa, антибиотикорезистентность, нозокомиальные инфекции

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(4):280-286

Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Staphylococcus aureus в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011–2012 гг.

М.В. Сухорукова, Е.Ю. Склеенова, Н.В. Иванчик, А.В. Тимохова, М.В. Эйдельштейн, А.В. Дехнич, Р.С. Козлов, исследовательская группа «МАРАФОН»

В исследование было включено 284 клинических нозокомиальных штамма S. aureus, выделенных в 2011–2012 гг. от пациентов, госпитализированных в 25 стационарах 18 городов различных регионов России. Чувствительность к 19 антимикробным препаратам была определена методом двукратных серийных разведений в соответствии с рекомендациями EUCAST (Ver. 4.0 2014). Из 284 включенных в исследование штаммов 190 (66,9%) являлись метициллинорезистентными (MRSA). Наибольшей активностью обладали гликопептиды (ванкомицин) и оксазолидиноны (линезолид), к которым были чувствительны все исследованные штаммы. Также высокую активность продемонстрировали даптомицин, фузидин, мупироцин, ко-тримоксазол и тигециклин: чувствительными к первым трём препаратам были 99,6%, к ко-тримоксазолу — 97,2%, к тигециклину — 95% штаммов. Остальные антибиотики проявляли низкую или умеренную активность — от 30,6% для ципрофлоксацина до 85,2% для рифампицина. Штаммы MRSA отличались существенно более низкой чувствительностью, по сравнению с MSSA, к гентамицину (24,7% vs 94,7%), клиндамицину (53,7 vs 96,8%), рифампицину (78,9% vs 97,9%), тетрациклину (46,8% vs 91,5%), хлорамфениколу (16,8% vs 85,1%), цефтаролину (57,9% vs 100%), ципрофлоксацину (1,6% vs 89,4%) и эритромицину (42,6% vs 89,4%).

Staphylococcus aureus, антибиотикорезистентность, нозокомиальные инфекции, MRSA

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(4):287-293

Оценка распространённости «классических» механизмов устойчивости к фторхинолонам у Chlamydia trachomatis, связанных с мутациями в генах топоизомераз

И.А. Эйдельштейн, М.В. Эйдельштейн, Е.В. Шипицына, Т.А. Хуснутдинова, А.М. Савичева, Р.С. Козлов

До настоящего времени мутационная устойчивость C. trachomatis к фторхинолонам, которые используются, наряду с макролидами и тетрациклинами, для лечения хламидийных инфекций, не была описана в клинической практике. Возможность селекции мутаций резистентности к фторхинолонам (преимущественно в участке QRDR gyrA) была продемонстрирована исключительно в экспериментах in vitro. В России фторхинолоны широко используются и доступны в аптечной сети без рецепта, что потенциально оказывает селективное давление на развитие устойчивости к ним у различных видов возбудителей, включая возбудителей инфекций, передающихся половым путём. С помощью ПЦР в режиме реального времени (ПЦР-РВ) 1572 клинических образца, полученных от пациентов с инфекциями урогенитального тракта, содержащих ДНК C. trachomatis, а также 200 отрицательных клинических образцов (контроль специфичности) были исследованы на наличие любых мутаций в QRDR участках генов-мишеней: gyrA и parC C. trachomatis, способных вызывать снижение чувствительности к фторхинолонам. В единственном образце анализ с использованием ПЦР-РВ и последующего секвенирования выявил наличие однонуклеотидной транзиции A/G в области связывания ПЦР-зонда, которая соответствует аминокислотной замене Ser-83/Gly в QRDR GyrA. Таким образом, впервые выявлено наличие типичной мутации устойчивости к фторхинолонам в QRDR gyrA в клиническом штамме C. trachomatis. Проведённое исследование показывает, что «классические» механизмы резистентности к фторхинолонам встречаются крайне редко в популяции клинических штаммов C. trachomatis.

Chlamydia trachomatis, фторхинолоны, топоизомеразы, QRDR, GyrA, мутации

Фармакоэпидемиология и фармакоэкономика

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(4):294-311

Потребление и затраты на системные антимикробные препараты в отделениях реанимации и интенсивной терапии многопрофильных стационаров Российской Федерации и Республики Беларусь: результаты многоцентрового фармакоэпидемиологического исследования

Ю.А. Белькова, С.А. Рачина, Р.С. Козлов, В.М. Мищенко, Р.А. Павлюков, С.Н. Козлов, А.И. Абубакирова, Б.В. Бережанский, Н.А. Зубарева, И.А. Карпов, Ш.Х. Палютин, У.С. Портнягина, Е.К. Самуйло

С целью проанализировать структуру потребления и затраты на антимикробные препараты (АМП) для системного применения в отделениях реанимации и интенсивной терапии (ОРИТ) многопрофильных стационаров различных регионов Российской Федерации и Республики Беларусь, в 2009–2010 гг. предпринят ретроспективный сбор информации на основании записей расходных накладных документов лечебно-профилактических учреждений (ЛПУ). Для оценки потребления использовалась ATC/DDD методология, результаты представлены в виде количества DDD/100 койко-дней (DBD).

Уровни потребления АМП в ОРИТ в 2009 и 2010 гг. составили в среднем 122,5 DBD и 133,8 DBD, средние затраты на закупку АМП для указанного отделения — 2,1 млн руб. и 2,4 млн руб., средняя стоимость 1 DDD — 444,1 и 459,8 руб. соответственно. В структуре потребления преобладали антибактериальные препараты — J01 (97,6% в 2009 г. и 98,1% в 2010 г.), в первую очередь бета-лактамные антибиотики непенициллинового ряда — J01D, (62,8 и 56,4%), другие антибактериальные препараты — J01Х, (12,4 и 13,6% соответственно), а также хинолоны — J01M, (12,4% в 2009 г.) и аминогликозиды — J01G, (10% в 2010 г.); в структуре затрат — антибактериальные препараты — J01 (97,9% в 2009 г. и 98,4% в 2010 г.), в первую очередь бета-лактамные антибиотики непенициллинового ряда — J01D (72,4 и 67,7%), другие антибактериальные препараты — J01Х (13,9 и 8,5% соответственно), а также хинолоны — J01M (6,7% в 2009 г.) и аминогликозиды — J01G (7,7% в 2010 г.). Уровень потребления АМП, расцененных как нерациональные, был неоправданно высоким (12,2% в 2009 г. и 11,1% в 2010 г.), тогда как затраты на закупку средств данной категории оказались не столь значимыми (2 и 1,4% соответственно).

Полученные данные могут быть использованы с целью оптимизации закупок АМП для ОРИТ, а также создания грамотной стратегии использования АМП в указанных отделениях и оценки её эффективности.

отделение реанимации и интенсивной терапии, ОРИТ, системные антимикробные препараты, потребление, затраты

Лабораторная диагностика

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2014; 16(4):312-324

Алгоритм микробиологической диагностики хронической инфекции лёгких у больных муковисцидозом

М.Ю. Чернуха, Л.Р. Аветисян, И.А. Шагинян, Г.В. Алексеева, Л.В. Авакян, Н.Ю. Каширская, Н.И. Капранов, С.Ю. Семыкин, Е.А. Сиянова, О.С. Медведева, С.А. Красовский, М.В. Усачева, Е.И. Кондратьева, Е.Л. Амелина, А.Г. Чучалин, А.Л. Гинцбург

Цель работы — разработать алгоритм микробиологической диагностики хронической инфекции лёгких у больных муковисцидозом и апробировать его для мониторинга хронической инфекции у больных детей и взрослых. При разработке алгоритма использовали результаты собственных исследований за период 2008–2013 гг. и данные литературы. В динамике на протяжении двух лет были обследованы 251 ребёнок и 26 взрослых, больных муковисцидозом. Для идентификации бактерий использовали бактериологические, биохимические и молекулярно-биологические методы исследования. Установлено, что микроорганизмы в клиническом материале в 2/3 случаев встречаются в ассоциациях, при этом доминирующими у больных с тяжёлым течением являются Pseudomonas aeruginosa (30,5%), Burkholderia cepacia complex (28,7%), Staphylococcus aureus (53,3%) и Achromobacter xylosoxidans (19%) и грибы рода Candida (57,5%). При микробиологическом мониторинге инфекции с интервалом от 3 мес. до 4 лет у 24 детей, больных МВ, с использованием разработанного алгоритма была выявлена хроническая инфекция у 18 пациентов, связанная с бактериями Burkholderia cepacia complex, у 6 — с A. xylosoxidans, у 5 — с P. aeruginosa, у 7 — с S. aureus.

муковисцидоз, алгоритм диагностики, смешанная инфекция