Клиническая Микробиология и Антимикробная Химиотерапия
2018; Том 20 (1): 1-72

Болезни и возбудители

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2018; 20(1):5-8

Вакцинопрофилактика пневмококковых инфекций у взрослых

Козлов Р.С., Авдеев С.Н., Брико Н.И., Биличенко Т.Н., Костинов М.П., Сидоренко С.В., Харит С.М., Синопальников А.И., Зайцев А.А., Шубин И.В., Демко И.В., Игнатова Г.Л., Рачина С.А., Фельдблюм И.В.

В ходе совета экспертов обсуждены ключевые вопросы профилактики пневмококковой инфекции (ПИ): ситуация с заболеваемостью внебольничной пневмококковой пневмонией (ВП) и другими ПИ, особенности локальной эпидемиологии, роста резистентности и замещения штаммов пневмококка, существующие международные и российские клинические рекомендации, текущие практические подходы, охват вакцинацией взрослого населения РФ. Сформулировано консолидированное мнение о необходимости разграничения использования конъюгированных и полисахаридных вакцин в разных группах населения.

пневмококковая инфекция, вакцины, взрослые, пневмококковая полисахаридная вакцина

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2018; 20(1):10-13

Вакцины для путешественников и вакцины для взрослых: стрельба по движущимся мишеням!

Макинтош Д.

В данном кратком обзоре представлена актуальная информация в отношении проблем вакцинации путешественников и взрослых в целом, включая такие заболевания, как гепатит В, менингококковую инфекцию, бешенство, жёлтую лихорадку, корь. В статье представлены общие принципы подходов к вакцинации, сделаны акценты применительно к указанным заболеваниям и рассмотрены потенциальные перспективы решения данной проблемы.

вакцинация, путешественники, взрослые

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2018; 20(1):14-23

Биологические свойства и вирулентность Helicobacter pylori

Исаева Г.Ш., Валиева Р.И.

В данном обзоре обобщены последние научные данные о биологических свойствах Helicobacter pylori (морфологических, культуральных, биохимических). Подробно описаны факторы патогенности H. pylori, отвечающие за колонизацию, адгезию, образование плёнок, агрессию и цитотоксичность, их значение в патогенезе заболеваний, а также возможные взаимосвязи с различными клиническими исходами инфекции. Также рассмотрены вопросы генетического разнообразия штаммов H. pylori, которое может быть важным фактором в развитии различных клинических проявлений и иметь значение для проведения эпидемиологических исследований.

Helicobacter pylori, факторы патогенности, вирулентность, цитотоксичность, адгезия, биоплёнки, гетерогенность

Антимикробные препараты

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2018; 20(1):24-34

Цефтазидим-авибактам: новые «правила игры» против полирезистентных грамотрицательных бактерий

Козлов Р.С., Стецюк О.У., Андреева И.В.

Стремительное распространение полирезистентных грамотрицательных бактерий в стационарах во всех странах мира потребовало поиска новых способов преодоления антимикробной резистентности. Цефтазидим-авибактам является первым зарегистрированным препаратом, в состав которого входит новый ингибитор бета-лактамаз с уникальными свойствами. В данном обзоре рассмотрены особенности спектра активности, фармакологические характеристики, данные об эффективности и безопасности цефтазидима-авибактама, полученные как в клинических исследованиях, так и в реальной клинической практике, а также перспективы дальнейших исследований препарата и его клинического применения.

грамотрицательные бактерии, полирезистентность, ингибитор бета-лактамаз, цефтазидим-авибактам

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2018; 20(1):35-40

Место даптомицина в лечении инфекционного эндокардита

Попов Д.А.

В обзоре дана характеристика даптомицина как высокоэффективного препарата группы липопептидов, активного в отношении грамположительных микроорганизмов, включая полирезистентные штаммы. Представлены данные, отражающие современные подходы к антибиотикотерапии инфекционного эндокардита на основе даптомицина, использующие преимущества данного препарата по сравнению со стандартными режимами лечения. Приведённые данные проиллюстрированы клиническими примерами.

инфекционный эндокардит, даптомицин, лечение

Антибиотикорезистентность

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2018; 20(1):42-48

Антибиотикорезистентность Helicobacter pylori в Смоленске

Дехнич Н.Н., Иванчик Н.В., Козлов Р.С., Алимов А.В., Стешиц А.С., Кирсов П.П.

Цель. Изучить динамику резистентности штаммов H. pylori к кларитромицину, амоксициллину, метронидазолу, левофлоксацину и тетрациклину у взрослых пациентов в Смоленской области за период с 2009 по 2017 гг.

Материалы и методы. Было обследовано 573 взрослых пациентов в 2015-2017 гг. и 210 пациентов в 2009-2010 гг. с положительным быстрым уреазным тестом, проходивших эзофагогастродуоденоскопию по поводу диспепсических жалоб. Определялась чувствительность выделенных штаммов H. pylori к кларитромицину, амоксициллину, метронидазолу, левофлоксацину и тетрациклину методом разведения в агаре.

Результаты. Было протестировано 143 штамма Н. pylori, выделенных в 2015-2017 гг., и 133 штамма Н. pylori, выделенных в 2009-2010 гг. Уровень резистентности штаммов Н. pylori, выделенных в 2015-2017 гг., к кларитромицину составил 6,3%, амоксициллину — 1,4%, метронидазолу — 23,8%, левофлоксацину — 24,5%, тетрациклину — 0,7%. Уровень резистентности штаммов Н. pylori, выделенных в 2009-2010 гг., к кларитромицину составил 5,3%, амоксициллину — 4,5%, метронидазолу — 3,8%, левофлоксацину — 8,3%, тетрациклину — 0%. При оценке динамики антибиотикорезистентности H. pylori в Смоленской области за последние 9 лет не выявлено значимого роста числа устойчивых штаммов к кларитромицину, амоксициллину и тетрациклину (p>0,05), однако отмечен достоверный рост уровня резистентности H. pylori к метронидазолу и левофлоксацину (p<0,01). При этом устойчивость H. pylori к метронидазолу не превысила критического значения в 40%.

Выводы. Распространённость резистентных штаммов H. pylori к кларитромицину и метронидазолу в Смоленской области остаётся низкой, поэтому стандартная тройная терапия рекомендуется как эмпирическая терапия инфекции H. pylori первой линии у взрослых. Предпочтение при выборе эмпирической терапии второй линии между квадротерапией с препаратом висмута и тройной терапией с левофлоксацином целесообразно отдавать квадротерапии с препаратом висмута из-за высокого уровня резистентности H. pylori к левофлоксацину.

Helicobacter pylori, резистентность, кларитромицин, амоксициллин, метронидазол, левофлоксацин

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2018; 20(1):49-54

Определение чувствительности клинических штаммов Candida glabrata к эхинокандинам с помощью системы Sensititre™ YeastOne™

Веселов А.В., Васильева Н.В., Богомолова Т.С., Рауш Е.Р., Куцевалова О.Ю., Нижегородцева И.А., Петрова Л.В., Шмидт Н.В., Москвитина Е.Н., Сухорукова М.В., Иванчик Н.В., Козлов Р.С.

Цель. Определение чувствительности штаммов C. glabrata к анидулафингину, каспофунгину и микафунгину с помощью системы Sensititre™ YeastOne™ (SYO).

Материалы и методы. Штаммы C. glabrata собирали проспективно из клинического материала и из коллекций штаммов центров-участников. Определение чувствительности проводили с помощью SYO (панель YO10) в соответствии с рекомендациями производителя. Интерпретацию результатов проводили в соответствии с протоколом CLSI M27-A3. Также определяли чувствительность C. glabrata к флуконазолу для оценки возможных корреляций минимальных подавляющих концентраций (МПК) ЭК и флуконазола у резистентных штаммов.

Результаты. Всего было протестировано 59 штаммов C. glabrata, которые были выделены преимущественно из крови, взятой из периферической вены (44%). Среди клинически значимых состояний/факторов риска и сопутствующих заболеваний, наличие центрального венозного катетера, солидные опухоли и абдоминальное хирургическое вмешательство имели место у 20 (33,9%), 19 (32,2%) и 14 (23,7%) пациентов соответственно. Большинство значений МПК ЭК были в пределах от 0,015 до 0,03 мг/л. Значения МПК каспофунгина были несколько выше, чем у анидулафунгина и микафунгина. Ни один из штаммов не был устойчив к какому-либо ЭК. Терапию ЭК на момент взятия биообразца получали только 2 пациента (без информации об эффективности терапии). Штаммы от этих больных также были чувствительны к ЭК. Все изоляты C. glabrata имели дозозависимую чувствительность к флуконазолу со значениями МПК от 2 до 32 мг/л.

Выводы. Все три ЭК обладали высокой сравнимой активностью in vitro в отношении C. glabrata, включая штаммы с дозозависимой чувствительностью к флуконазолу. Необходимы дальнейшие проспективные исследования для оценки долгосрочных тенденций в показателях чувствительности возбудителей кандидоза, особенно C. glabrata.

Candida glabrata, кандидоз, эхинокандины, резистентность

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2018; 20(1):55-61

Использование селективной хромогенной среды для детекции ванкомицинорезистентных энтерококков

Фёдорова А.В., Клясова Г.А.

Цель. Изучить детекцию ванкомицинорезистентных энтерококков на селективной среде CHROMagar™VRE (CHROMagar, Франция).

Материалы и методы. В первой части исследовали 39 ванкомицинорезистентных и 20 ванкомициночувствительных штаммов Enterococcus spp., выделенных из гемокультуры, с известными параметрами чувствительности на среде CHROMagar™VRE в течение 24 ч и 48 ч инкубации. Во второй части проводили скрининг 110 мазков, взятых со слизистой оболочки прямой кишки, от больных гемобластозами. Чувствительность к ванкомицину изолятов, выделенных на селективной среде, дополнительно изучали методом серийных микроразведений в бульоне (CLSI, 2017). Генотипы резистентности к гликопептидам определяли методом ПЦР.

Результаты. При исследовании Enterococcus spp. с известными параметрами чувствительности на среде CHROMagar™VRE было выделено 36 (92,3%) изолятов через 24 ч, и ещё 2 изолята — через 48 ч инкубации. Чувствительность CHROMagar™VRE для выделения ванкомицино­резистентных энтерококков из гемокультуры составила 92,3% при инкубации в течение 24 ч и 97,4% — в течение 48 ч. При исследовании 20 ванкомициночувствительных Enterococcus spp. на CHROMagar™VRE не было получено роста микроорганизмов (специфичность 100%). При исследовании 110 мазков со слизистой прямой кишки на CHROMagar™VRE Enterococcus spp. были выделены из 35 (31,8%) образцов (33 — E. faecium и 2 — E. faecalis). Устойчивыми к ванкомицину были 32 из 33 (97%) штаммов E. faecium, из них 28 штаммов E. faecium — через 24 ч инкубации и 4 штамма E. faecium — через 48 ч; все изоляты имели vanA ген. При скрининге ванкомицинорезистентных энтерококков со слизистой оболочки прямой кишки доля ложноположительных изолятов, выделенных на CHROMagar™VRE, составила 3,4% и 8,6% при инкубации в течение 24 ч и 48 ч соответственно.

Выводы. Селективная хромогенная среда CHROMagar™VRE имеет высокую чувствительность и специфичность для выявления ванкомицинорезистентных энтерококков и может быть использована в лабораторной практике.

хромогенная селективная среда, ванкомицинорезистентные энтерококки, Enterococcus faecium, антибиотикорезистентность

Опыт работы

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2018; 20(1):62-67

Определение чувствительности к антибиотикам методом микроразведений в бульоне: модификация, доступная для всех

Тапальский Д.В., Бильский И.А.

Цель. Оценить возможность использования стандартных дисков в качестве источника антибиотиков для определения минимальных подавляющих концентраций (МПК) методом последовательных микроразведений.

Материалы и методы. Предложен простой метод приготовления рабочих растворов с использованием в качестве источника антибиотиков стандартных бумажных дисков, имеющихся в большинстве микробиологических лабораторий. Проведено многократное определение МПК антибиотиков для штаммов E. coli ATCC 25922 и P. aeruginosa ATCC 27853.

Результаты. Из 576 значений МПК, определенных с помощью модифицированного метода, референтным значениям контрольных штаммов соответствовали 78,5% полученных результатов, ещё 20,8% результатов относились к категории допустимых значений.

Выводы. Использование стандартных дисков в качестве источника антибиотиков для приготовления рабочих растворов значительно упрощает процедуру тестирования методом последовательных микроразведений и делает её доступной для большинства микробиологических лабораторий.

минимальная подавляющая концентрация, диски с антибиотиками, антибиотикорезистентность

Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2018; 20(1):68-72

Полногеномное секвенирование штаммов Mycoplasma hominis, устойчивых к ципрофлоксацину

Колесникова Е.А., Бруснигина Н.Ф., Махова М.А., Алексеева А.Е.

С целью определения молекулярного механизма резистентности к ципрофлоксацину были исследованы клинические изоляты Mycoplasma hominis (2 штамма), выделенные у женщин с воспалительными заболеваниями органов малого таза. Проведено полногеномное секвенирование на высокопроизводительном секвенаторе MiSeq (Illumina, США). Показано, что штаммы M. hominis M57 и M. hominis М45 обладают характерным для данного вида содержанием ГЦ-оснований — 27,2%. Установлена высокая степень гомологии белковых последовательностей штаммов M. hominis M57 и M.  hominis М45. Филогенетический анализ показал, что штамм M. hominis M57 эволюционно ближе расположен к штамму M. hominis PG21, а M. hominis M45 к M. hominis H34. Анализ аминокислотных последовательностей генов gyrA, gyrB, parC и parЕ изолятов M. hominis М45 и M. hominis М57 выявил, что молекулярный механизм их резистентности к ципрофлоксацину обусловлен наличием мутационного изменения в QRDR области гена gyrA (субъединица А ДНК-гиразы) с заменой серина (Ser) на лейцин (Leu) в позиции 83. Мутаций, затрагивающих кодоны аминокислот в QRDR области генов gyrB, parC и parE, не обнаружено. Анализ структуры генов gyrA, gyrB, parC и parE показал высокую степень полиморфизма, обусловленную высокой частотой спонтанных мутаций. Определено, что в геноме штаммов M. hominis М45 и M. hominis М57 присутствуют гены семейства эффлюксной системы MATE, но на сегодняшний день их роль в развитии резистентности M. hominis экспериментально не доказана.

Mycoplasma hominis, полногеномное секвенирование, резистентность, ципрофлоксацин, gyrA, мутации